Функцию движения у протозоа выполняют временные образования — псевдоподии и постоянные — жгутики и реснички.
Решающее значение иногда приобретают изгибы тела, как это свойственно ряду жгутиковых и др. Многие жгутиковые и инфузории из плавающих в толще воды поступательное движение совершают преимущественно за счет винтообразного вращения тела, направляемого движением жгутика или ресничек. В рамках каждого из отмеченных способов движения имеется значительное разнообразие с большим числом вариаций.
Движение у одноклеточных животных, как и у многоклеточных, связано с наличием особых контрактильных (сократительных) белков, отличающихся крупными молекулами волокнистой структуры. Такие белки (актиновые и мизиновые), ранее выявленные в миофибриллах мышечных клеток, обнаружены и в протоплазме протозоа, и в их органоидах движения — жгутиках и ресничках. Таким образом, в природе двигательной функции у животных того и другого подцарства прослеживаются аналогичные черты.
Ультраструктура жгутиков и ресничек протозоа, как и жгутиков и ресничек метазоа (в мерцательном эпителии, у сперматозоидов и пр.), показывает сходные черты в фибриллярном строении — наличие в каждой ресничке и в каждом жгутике 11 волоконец (нитей), расположенных продольно. Из них девять находятся на периферии и два занимают центральное положение .
Во всех случаях основание жгутиков и ресничек в пелликуле имеет вид гранулы, называемой базальным тельцем. У жгутиковых базальное тельце часто называют блефаропластом, а у инфузорий — кинетосомой. С базальным тельцем связаны особые фибриллы — корневые нити, которые у жгутиковых простираются в глубь тела, иногда достигая ядра.
Двигательный аппарат ряда высших протозоа (инфузорий) показывает сложность расположения фибрилл .
. Реснички отличаются от жгутиков многочисленностью иа теле и малой длиной. Усиление функций ресничек связано со слиянием их, что приводит к образованию толстых протоплазматических придатков наподобие ног (как у бегающих стилонихий, рис. 34), щупалец, мембран специального назначения, например в пред-ротовом углублении и т. д. Иногда подобное наблюдается и у жгутиковых.